Введение в компьютерное моделирование био- и наноструктур
IV курс, VIII семестр, специализация «Нанобиоматериалы и нанобиотехнологии» (подгруппа НБ1).
Лекторы — с.н.с., к.ф-м.н. Упоров Игорь Владимирович (химический факультет МГУ); ст. преподаватель, к.х.н. Головин Андрей Викторович (факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ).
26 часов.
Курс сочетает в себе как лекционные занятия для изучения теоретических основ методов компьютерного моделирования, так и практические занятия, в ходе которых происходит закрепление полученных знаний на модельных примерах.
Компьютерное моделирование нанобиоструктур является важным инструментом исследования их свойств и способствует более глубокому осмыслению структурно-функциональных особенностей этих объектов. Нанобиообъекты построены из составляющих блоков – пептидов и белков, нуклеиновых кислот, искусственных и биологических мембран. Задачей компьютерного моделирование является построение моделей пространственной структуры каждого из составляющих блоков, и затем сборка этих объектов в цельный объект с использованием инструментов компьютерной графики. Методы компьютерного моделирования пространственных структур пептидов, белков и нуклеиновых кислот хорошо разработаны и широко применяются в научных исследованиях. Знакомству с этими методами посвящён предлагаемый курс.
В силу химических различий между объектами белковой природы и нуклеиновыми кислотами методы моделирования их пространственной структуры также различаются, что отражено в структуре курса, который разбит на две части – моделирование структур белков и пептидов и моделирование структур нуклеиновых кислот.
