Учебная программа для студентов Химического факультета и ФББ (группа НБ1) и для студентов Биологического факультета кафедр биофизики и биоинженерии (группы НБ2 и НБ3 соответственно) различны.
| Название дисциплины | Количество учебных часов | Обязательность | Отчетность | Преподаватель |
| «Введение в физику наноструктур» | 20 | для всех | зачет | Головин Ю.И. |
| Составной курс «Нанобиоматериалы и фундаментальные основы нанобиотехнологий» | 36 | для всех | экзамен | Родина Е.В., Курочкин И.Н., Зиновкин Р.А., Готтих М.Б., Зверева М.Э., Ярославов А.А., Пышкина О.А. |
| «Кристаллохимия и белковая кристаллография» | 48 | ХФ | зачет | Гринева О.В., Миронов А.В., Куранова И.П., Родина Е.В. |
| «Высокомолекулярные соединения» | 26 | ХФ | зачет | Лысенко Е.А. |
| «Коллоидные системы» | 36 | ХФ | экзамен | Виноградова О.И. |
| Название дисциплины | Количество учебных часов | Отчетность | Преподаватель |
| «Нанобиотехнологии» | 32 | зачет | Максимов Г.В., Курочкин И.Н., Шеховцова Т.Н. |
| Гуманитарный спецкурс «Инновационный бизнес» | 36 | зачет |
| Название дисциплины | Количество учебных часов | Отчетность | Преподаватель |
| Введение в физику конденсированных сред и макромолекул | 28 | зачет | Красильников П.М., Левшин Н.Л., Тамм М.В. |
| Динамика и функционирование нанобиоструктур (фотобиология) | |||
| Наноструктуры биологической мембраны | экзамен | Ю.А. Чизмаджев, П.М. Красильников | |
| Физика белка | 42 | Финкельштейн А.В. | |
| Физика нуклеиновых кислот | 24 | Лившиц М.А. | |
| Основы генной инженерии | Шатский И.Н. | ||
| Спецпрактикум по выбору |
| Название дисциплины | Количество учебных часов | Отчетность | Преподаватель |
| Математические модели клеточных процессов | Ризниченко Г.Ю. | ||
| Выполнение дипломной работы | |||